Trayectoria científica Licenciada en Ciencias Biológicas en 1997 por la Universidad de Málaga. Un año más tarde me incorporo al Departamento de Biología Molecular y Bioquímica con una beca de colaboración, la cual me ofrece la posibilidad de realizar mis primeras aproximaciones al campo de la investigación, desarrollando marcadores moleculares para la identificación varietal de especies de olivo. Ese trabajo culmina con una Tesis de Licenciatura en el 2001, dos patentes de la Universidad de Málaga y, finalmente, es premiado en la IV Edición de los Premios de Ciencia y Tecnología “Severo Ochoa” Ateneo-Universidad de Málaga. Finalizada esta etapa comienzo con otros trabajos de investigación siempre dentro del campo de la biología molecular y el análisis de datos biológicos, obteniendo el grado de Doctor en Biología por el Departamento de Biología Molecular y Bioquímica de la Universidad de Málaga en el 2008. Ese mismo año me incorporo como doctor responsable de la Unidad de Bioinformática del Centro de Supercomputación y Bioinnovación de la Universidad de Málaga. Toda mi trayectoria profesional me llevan a especializarse en el análisis masivo de datos biológicos, desarrollando nuevos algoritmos analíticos para la resolución de problemas biológicos complejos. Hasta el momento he participado en 48 publicaciones en revistas científicas, además, formo parte del equipo de diversos proyectos de investigación coordinados con distintos Centros de Investigación y Universidades andaluzas, todos relacionados con el análisis masivo de datos biológicos y la extracción de conocimiento de los mismos. En la parte docente, he participado en la co-dirección de TFG, TFM y Tesis doctorales. Comprometida firmemente con la divulgación científica, soy la Presidenta de la Asociación Cultural Ateneo Mijas, la cual organiza cada año unas jornadas divulgativas de la ciencia en mi municipio. Trayectoria divulgativa Desde hace más de cinco años vengo desarrollando, de forma activa, distintos eventos divulgativos con dos objetivos principales: el primero es llevar a la ciudadanía las investigaciones que se realizan en nuestros laboratorios de investigación utilizando un lenguaje claro y sencillo, el segundo objetivo es el de motivar a las chicas a cursas disciplinas STEM (Ciencias, Tecnología, Ingenierias y Mátemáticas). En este sentido, participo en La Noche Europea de Los Investigadores. También he participado en sendos capítulos del programa TESIS de la Radio-Televisión Andaluza.
Actualizaciones Recientes
  • ¿Te has preguntado alguna vez de dónde proviene el popular formato de secuencias FASTA? Os dejo un hilo que he escrito para @scbi_uma sobre el omnipresente formato de secuencias FASTA
    ¡espero que os guste!
    https://twitter.com/Rociobm1/status/1463850415104090113?s=20
    ¿Te has preguntado alguna vez de dónde proviene el popular formato de secuencias FASTA? Os dejo un hilo que he escrito para @scbi_uma sobre el omnipresente formato de secuencias FASTA ¡espero que os guste! https://twitter.com/Rociobm1/status/1463850415104090113?s=20
    3
    0 Comentarios 0 Compartido
  • 📣 🔔 Pues ya tenemos el niño en el mundo, nace @scbi_uma el canal de nuestro Centro de Supercomputación y Bionnovación en la Universidad de Málaga, desde el que os contaremos todo lo que vamos desarrollando en el edificio a nivel científico. ¡Seguidnos, seguidnos, que esto promete 😁😁 ! 🔬 🧬 ⚗️ 🦠 🧫 💉 🩺 🧪 💻 💽 👩‍🔬 👨‍🔬
    #SCBI #Uma #bioinformatics

    https://twitter.com/scbi_uma/status/1460898069361397760?s=20
    📣 🔔 Pues ya tenemos el niño en el mundo, nace @scbi_uma el canal de nuestro Centro de Supercomputación y Bionnovación en la Universidad de Málaga, desde el que os contaremos todo lo que vamos desarrollando en el edificio a nivel científico. ¡Seguidnos, seguidnos, que esto promete 😁😁 ! 🔬 🧬 ⚗️ 🦠 🧫 💉 🩺 🧪 💻 💽 👩‍🔬 👨‍🔬 #SCBI #Uma #bioinformatics https://twitter.com/scbi_uma/status/1460898069361397760?s=20
    3
    0 Comentarios 0 Compartido
  • https://www.divulganatura.com/el-tamano-no-siempre-importa/
    https://www.divulganatura.com/el-tamano-no-siempre-importa/
    El tamaño no siempre importa
    5
    0 Comentarios 0 Compartido
  • Un artículo nos muestra como las floraciones microbianas pudieron retrasar la recuperación del ecosistema de agua dulce después de la extinción del Pérmico.

    Resumen:

    Las proliferaciones de algas y bacterias nocivas relacionadas con la deforestación, la pérdida de suelo y el calentamiento global son cada vez más frecuentes en lagos y ríos. Demostramos que los cambios climáticos y la deforestación pueden impulsar la proliferación microbiana recurrente, inhibiendo la recuperación de los ecosistemas de agua dulce durante cientos de milenios. De las sucesiones estratigráficas de la cuenca de Sydney, Australia, nuestros datos fósiles, sedimentarios y geoquímicos revelan eventos de floración luego del colapso del ecosistema forestal durante la extinción masiva más severa en la historia de la Tierra, el evento del final del Pérmico (EPE; c. 252.2 Ma). Las comunidades microbianas proliferaron en masas de agua dulce y salobre de las tierras bajas, con concentraciones de algas típicas de las floraciones modernas. Estos se iniciaron antes de cualquier rastro de vegetación de recuperación posterior a la extinción, pero se repitieron episódicamente durante> 100 kyrs. Durante los siguientes 3 Myrs, las algas y las bacterias prosperaron en lagos y ríos efímeros, poco oxigenados y probablemente tóxicos. Las comparaciones con los registros mundiales de tiempo profundo indican que las floraciones microbianas son factores de estrés ecológico de agua dulce persistentes durante los eventos de extinción provocados por el calentamiento.

    Fuente: https://www.nature.com/articles/s41467-021-25711-3

    ESte trabajo ha sido noticia en relación a lo ocurrido en otros enclaves naturales donde se han producido muertes masivas en los últimos meses.

    https://www.laopiniondemalaga.es/verde-y-azul/2021/09/23/humanidad-calcando-causas-extincion-masiva-57592292.html?fbclid=IwAR14IOJwKghbZ2sXcHiAK-7rRnlz8hDb3QIaIZq4M2_lACknY4CN20ePDfA
    Un artículo nos muestra como las floraciones microbianas pudieron retrasar la recuperación del ecosistema de agua dulce después de la extinción del Pérmico. Resumen: Las proliferaciones de algas y bacterias nocivas relacionadas con la deforestación, la pérdida de suelo y el calentamiento global son cada vez más frecuentes en lagos y ríos. Demostramos que los cambios climáticos y la deforestación pueden impulsar la proliferación microbiana recurrente, inhibiendo la recuperación de los ecosistemas de agua dulce durante cientos de milenios. De las sucesiones estratigráficas de la cuenca de Sydney, Australia, nuestros datos fósiles, sedimentarios y geoquímicos revelan eventos de floración luego del colapso del ecosistema forestal durante la extinción masiva más severa en la historia de la Tierra, el evento del final del Pérmico (EPE; c. 252.2 Ma). Las comunidades microbianas proliferaron en masas de agua dulce y salobre de las tierras bajas, con concentraciones de algas típicas de las floraciones modernas. Estos se iniciaron antes de cualquier rastro de vegetación de recuperación posterior a la extinción, pero se repitieron episódicamente durante> 100 kyrs. Durante los siguientes 3 Myrs, las algas y las bacterias prosperaron en lagos y ríos efímeros, poco oxigenados y probablemente tóxicos. Las comparaciones con los registros mundiales de tiempo profundo indican que las floraciones microbianas son factores de estrés ecológico de agua dulce persistentes durante los eventos de extinción provocados por el calentamiento. Fuente: https://www.nature.com/articles/s41467-021-25711-3 ESte trabajo ha sido noticia en relación a lo ocurrido en otros enclaves naturales donde se han producido muertes masivas en los últimos meses. https://www.laopiniondemalaga.es/verde-y-azul/2021/09/23/humanidad-calcando-causas-extincion-masiva-57592292.html?fbclid=IwAR14IOJwKghbZ2sXcHiAK-7rRnlz8hDb3QIaIZq4M2_lACknY4CN20ePDfA
    WWW.NATURE.COM
    Lethal microbial blooms delayed freshwater ecosystem recovery following the end-Permian extinction - Nature Communications
    Harmful algal and bacterial blooms are increasingly frequent in lakes and rivers. From the Sydney Basin, Australia, this study uses fossil, sedimentary and geochemical data to reveal bloom events following forest ecosystem collapse during the end-Permian event and that blooms have consistently followed warming-related extinction events, inhibiting the recovery of freshwater ecosystems for millennia.
    3
    0 Comentarios 0 Compartido
  • Un volcán entra en erupción en una "zona no poblada" de Cumbre Vieja en La Palma.

    https://www.niusdiario.es/sociedad/medio-ambiente/palma-canarias-erupciona-volcan-cumbre-vieja_18_3205395884.html
    Un volcán entra en erupción en una "zona no poblada" de Cumbre Vieja en La Palma. https://www.niusdiario.es/sociedad/medio-ambiente/palma-canarias-erupciona-volcan-cumbre-vieja_18_3205395884.html
    WWW.NIUSDIARIO.ES
    Un volcán entra en erupción en una "zona no poblada" de Cumbre Vieja en La Palma
    Un volcán entra en erupción en una "zona no poblada" de Cumbre Vieja en La Palma, en concreto la zona de Las Manchas, según ha adelantado la...
    5
    0 Comentarios 0 Compartido
  • Un informe del Instituto Español de Oceanografía señala a la incesante entrada de fertilizantes procedentes de la agricultura intensiva y otras actividades humanas en el entorno ribereño como el motivo de la crisis de la laguna salada.
    https://www.agenciasinc.es/Noticias/Corroboran-que-la-agricultura-es-la-causa-principal-de-la-mortandad-masiva-de-fauna-en-el-Mar-Menor?fbclid=IwAR28YgHH38s7qQPvxR7pe6u9K57wjeByigaQpN1bRJzJ7-zgWUcpoiMUBVs
    Un informe del Instituto Español de Oceanografía señala a la incesante entrada de fertilizantes procedentes de la agricultura intensiva y otras actividades humanas en el entorno ribereño como el motivo de la crisis de la laguna salada. https://www.agenciasinc.es/Noticias/Corroboran-que-la-agricultura-es-la-causa-principal-de-la-mortandad-masiva-de-fauna-en-el-Mar-Menor?fbclid=IwAR28YgHH38s7qQPvxR7pe6u9K57wjeByigaQpN1bRJzJ7-zgWUcpoiMUBVs
    WWW.AGENCIASINC.ES
    Corroboran que la agricultura es la causa principal de la mortandad masiva de fauna en el Mar Menor
    Un informe del Instituto Español de Oceanografía señala a la incesante entrada de fertilizantes procedentes de la agricultura intensiva y otras actividades humanas en el entorno ribereño como el motivo de la crisis de la laguna salada.
    5
    0 Comentarios 0 Compartido
  • Desgranando Ciencia celebra su séptima edición volviendo a la presencialidad después del parón de 2020 por la irrupción de la pandemia de la Covid19. El hashtag de este año para redes sociales será #Desgrana7.

    https://granada.hablandodeciencia.com/programa-desgrana7/
    Desgranando Ciencia celebra su séptima edición volviendo a la presencialidad después del parón de 2020 por la irrupción de la pandemia de la Covid19. El hashtag de este año para redes sociales será #Desgrana7. https://granada.hablandodeciencia.com/programa-desgrana7/
    Programa #Desgrana7
    4
    0 Comentarios 0 Compartido
  • https://twitter.com/Rociobm1/status/1437352651046391808?s=20
    https://twitter.com/Rociobm1/status/1437352651046391808?s=20
    1
    0 Comentarios 0 Compartido

  • ** Evaluación del rendimiento en la secuenciación de ADN utilizando plataformas de Next-Generation Sequencing (#NGS)**



    La evaluación de la reproducibilidad, la precisión y la utilidad de las distintas plataformas masivas de secuenciación de ADN sigue siendo un desafío continuo. En esta publicación de #NatureBiotechnology, Jonathan Foox y col. presentan un estudio, realizado por la Asociación de Recursos Biomoleculares (ABRF), donde se compara el rendimiento de distintas plataformas de #secuenciación mediante NGS, como son: HiSeq y NovaSeq, Ion S5 y Proton, PacBio, Oxford Nanopore Technologies PromethION y MinION, así como las plataformas BGISEQ-500 y MGISEQ-2000, en todos los casos utilizando de referencia #ADN #humano y ADN #bacteriano. Entre sus conclusiones destacan que en las plataformas de lecturas cortas de Illumina, tipo HiSeq 4000 y HiSeqX10, la cobertura del genoma es muy alta y robusta, mientras que en las plataformas de lecturas cortas, tipo BGI y MGISEQ, se observan tasas de error de secuenciación más bajas en comparación con las de Illumina. Por otro lado, en la plataforma de lecturas largas, tipo PacBio, la tasa de alineamiento de las lecturas a las distintas referencias utilizadas es más alta que en las plataformas de lecturas cortas. Las dos plataformas de lecturas largas, PacBio y, PromethION y MinION, muestran un porcentaje de mapeo de secuencias más alto en regiones ricas en repeticiones y regiones homopoliméricas. Por último, observan que, la plataforma de lecturas cortas NovaSeq 6000 de Illumina es el instrumento más robusto para identificar inserciones o deleciones nucleotídicas. En resumen, este estudio puede ser un punto de referencia para seleccionar las tecnologías de secuenciación genómicas más adecuadas a cada problemática, así que te recomendamos encarecidamente su lectura, no te lo puedes perder.

    El artículo está disponible en:

    https://www.nature.com/articles/s41587-021-01049-5.pdf
    ** Evaluación del rendimiento en la secuenciación de ADN utilizando plataformas de Next-Generation Sequencing (#NGS)** La evaluación de la reproducibilidad, la precisión y la utilidad de las distintas plataformas masivas de secuenciación de ADN sigue siendo un desafío continuo. En esta publicación de #NatureBiotechnology, Jonathan Foox y col. presentan un estudio, realizado por la Asociación de Recursos Biomoleculares (ABRF), donde se compara el rendimiento de distintas plataformas de #secuenciación mediante NGS, como son: HiSeq y NovaSeq, Ion S5 y Proton, PacBio, Oxford Nanopore Technologies PromethION y MinION, así como las plataformas BGISEQ-500 y MGISEQ-2000, en todos los casos utilizando de referencia #ADN #humano y ADN #bacteriano. Entre sus conclusiones destacan que en las plataformas de lecturas cortas de Illumina, tipo HiSeq 4000 y HiSeqX10, la cobertura del genoma es muy alta y robusta, mientras que en las plataformas de lecturas cortas, tipo BGI y MGISEQ, se observan tasas de error de secuenciación más bajas en comparación con las de Illumina. Por otro lado, en la plataforma de lecturas largas, tipo PacBio, la tasa de alineamiento de las lecturas a las distintas referencias utilizadas es más alta que en las plataformas de lecturas cortas. Las dos plataformas de lecturas largas, PacBio y, PromethION y MinION, muestran un porcentaje de mapeo de secuencias más alto en regiones ricas en repeticiones y regiones homopoliméricas. Por último, observan que, la plataforma de lecturas cortas NovaSeq 6000 de Illumina es el instrumento más robusto para identificar inserciones o deleciones nucleotídicas. En resumen, este estudio puede ser un punto de referencia para seleccionar las tecnologías de secuenciación genómicas más adecuadas a cada problemática, así que te recomendamos encarecidamente su lectura, no te lo puedes perder. El artículo está disponible en: https://www.nature.com/articles/s41587-021-01049-5.pdf
    2
    0 Comentarios 0 Compartido
  • El ARN, la molécula intérprete 🧬
    Todos sabemos que el ADN es la molécula que contiene la información para hacernos ser lo que somos. Todas nuestras células contienen esa información, con lo cual, a nivel de ADN todas son iguales, es decir, tienen las mismas instrucciones. Como toda información valiosa, estas instrucciones no se encuentran de cualquier manera, sino que se mantienen empaquetadas en unas estructuras llamadas cromosomas.

    Sin embargo, aunque todas las células tengan las mismas instrucciones podemos diferenciar perfectamente los distintos tipos celulares de nuestro organismo. Además, cada uno de estos tipos dan lugar finalmente a las distintas estructuras; por ejemplo, algunos tipos celulares formarán los músculos, otros la piel, otros los huesos, etc.

    ¿Cómo se lleva a cabo este proceso si todas las células tienen el mismo libro de instrucciones? Pues muy sencillo, todo parte de un proceso denominado transcripción, donde solo algunas de estas instrucciones, contenidas en el libro del ADN, se copian en otro tipo de molécula, el ARN, que hace de intérprete para, finalmente, acabar ejerciendo su acción en forma de proteína.

    ¿Recordáis la serie de libros Elige tu propia aventura? En estos libros teníamos la posibilidad de cambiar la historía en función de las páginas que deseáramos leer. Pues nuestro organismo, cuando se está desarrollando y nuestras células multiplicándose, es capaz de copiar en ARN solo ciertas partes de todo el ADN, dando lugar a distintas historias, distintos tipos de células, distintas estructuras, es decir, se expresa, como el lenguaje.

    Es mas, existen distintos tipos de moléculas ARN. Algunas son capaces de leer e interpretar ciertas partes del libro de nuestro ADN, son los denominados ARN mensajeros, los cuales dan instrucciones precisas para formar proteínas concretas, como si fuese una frase legible. Sin embargo, otros tipos de moléculas de ARN tienen la capacidad de regular el significado de esa frase, actuando como signos de puntuación de nuestra lengua, son los llamados ARN pequeños. Fíjate en la siguiente estructura, donde las palabras actuarían de ARN mensajero:

    ‘No me he ido’.

    ‘No, me he ido’.

    Un pequeño signo de puntuación, la coma, hace que el significado de ambas frases sea opuesto. El signo de puntuación sería un ARN pequeño capaz de regular el significado del mensaje contenido en el ADN. Como ves, todo es más complejo de lo que pensamos, tan complejo como el propio lenguaje. Nuestro ADN es una lengua viva con capacidad adaptativa.

    Fuente original en: https://www.divulganatura.com/el-arn-la-molecula-interprete/
    El ARN, la molécula intérprete 🧬 Todos sabemos que el ADN es la molécula que contiene la información para hacernos ser lo que somos. Todas nuestras células contienen esa información, con lo cual, a nivel de ADN todas son iguales, es decir, tienen las mismas instrucciones. Como toda información valiosa, estas instrucciones no se encuentran de cualquier manera, sino que se mantienen empaquetadas en unas estructuras llamadas cromosomas. Sin embargo, aunque todas las células tengan las mismas instrucciones podemos diferenciar perfectamente los distintos tipos celulares de nuestro organismo. Además, cada uno de estos tipos dan lugar finalmente a las distintas estructuras; por ejemplo, algunos tipos celulares formarán los músculos, otros la piel, otros los huesos, etc. ¿Cómo se lleva a cabo este proceso si todas las células tienen el mismo libro de instrucciones? Pues muy sencillo, todo parte de un proceso denominado transcripción, donde solo algunas de estas instrucciones, contenidas en el libro del ADN, se copian en otro tipo de molécula, el ARN, que hace de intérprete para, finalmente, acabar ejerciendo su acción en forma de proteína. ¿Recordáis la serie de libros Elige tu propia aventura? En estos libros teníamos la posibilidad de cambiar la historía en función de las páginas que deseáramos leer. Pues nuestro organismo, cuando se está desarrollando y nuestras células multiplicándose, es capaz de copiar en ARN solo ciertas partes de todo el ADN, dando lugar a distintas historias, distintos tipos de células, distintas estructuras, es decir, se expresa, como el lenguaje. Es mas, existen distintos tipos de moléculas ARN. Algunas son capaces de leer e interpretar ciertas partes del libro de nuestro ADN, son los denominados ARN mensajeros, los cuales dan instrucciones precisas para formar proteínas concretas, como si fuese una frase legible. Sin embargo, otros tipos de moléculas de ARN tienen la capacidad de regular el significado de esa frase, actuando como signos de puntuación de nuestra lengua, son los llamados ARN pequeños. Fíjate en la siguiente estructura, donde las palabras actuarían de ARN mensajero: ‘No me he ido’. ‘No, me he ido’. Un pequeño signo de puntuación, la coma, hace que el significado de ambas frases sea opuesto. El signo de puntuación sería un ARN pequeño capaz de regular el significado del mensaje contenido en el ADN. Como ves, todo es más complejo de lo que pensamos, tan complejo como el propio lenguaje. Nuestro ADN es una lengua viva con capacidad adaptativa. Fuente original en: https://www.divulganatura.com/el-arn-la-molecula-interprete/
    1
    0 Comentarios 0 Compartido
Quizás te interese…